[1] GROUP = 1 CLONOTYPES = 6 CELLS
[1.1] CLONOTYPE = 6 CELLS
┌──────────────────────────┬───────────────────────────────────────┬─────────────────────────────┐
│ │ CHAIN 1 │ CHAIN 2 │
│ │ 98|IGHV2-5 ◆ 13|IGHD2-15 ◆ 57|IGHJ5 │ 349|IGLV3-1 ◆ 311|IGLJ2 │
│ ├───────────────────────────────────────┼─────────────────────────────┤
│ │ 11111111111111111111 │ 11111111111 │
│ │ 8 11111222222222233333 │ 6 00000111111 │
│ │ 5 56789012345678901234 │ 2 56789012345 │
│ │ ════════CDR3════════ │ ════CDR3═══ │
│reference │ S ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦W │ V CQAWD◦◦◦◦◦◦ │
│donor ref │ S ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦W │ V CQAWD◦◦◦◦◦◦ │
├──────────────────────────┼───────────────────────────────────────┼─────────────────────────────┤
│# barcode n │ x ..x.......xx........ u const │ x ........... u const│
│1 3 │ S CALMGTYCSGDNCYSWFDPW 592 IGHM │ V CQAWDSSVVVF 2995 IGLC2│
│ CGTTCTGGTAGCCTCG-1 │ 592 │ 2995 │
│ GCGCCAAGTATTACCG-1 │ 104 │ 172 │
│ TGGCCAGGTTACGCGC-1 │ 6617 │ 12097 │
│2 1 │ S CALMGTYCSGDNCYSWFDPW 6218 IGHG1 │ V CQAWDSSVVVF 15182 IGLC2│
│ GACCTGGAGCGTGAAC-1 │ 6218 │ 15182 │
│3 1 │ T CALMGTYCSGDNCYSWFDPW 4033 IGHG1 │ V CQAWDSSVVVF 6777 IGLC2│
│ CTCCTAGCAAGGACAC-1 │ 4033 │ 6777 │
│4 1 │ S CAHMGTYCSGGSCYSWFDPW 18 IGHG1 │ V CQAWDSSVVVF 592 IGLC2│
│ AGCTTGACAATGGAGC-1 │ 18 │ 592 │
└──────────────────────────┴───────────────────────────────────────┴─────────────────────────────┘
barcode u1 u_cell1
CGTTCTGGTAGCCTCG-1 592 592
GCGCCAAGTATTACCG-1 592 104
TGGCCAGGTTACGCGC-1 592 6617
GACCTGGAGCGTGAAC-1 6218 6218
CTCCTAGCAAGGACAC-1 4033 4033
AGCTTGACAATGGAGC-1 18 18