[1] GROUP = 1 CLONOTYPES = 1 CELLS
[1.1] CLONOTYPE = 1 CELLS
┌───────────┬─────────────────────────────────────────────┬────────────────────────────────┐
│ │ CHAIN 1 │ CHAIN 2 │
│ │ 122.1.1|IGHV3-23 ◆ 22|IGHD3-9 ◆ 55|IGHJ4 │ 331|IGLV1-51 ◆ 311|IGLJ2 │
│ ├─────────────────────────────────────────────┼────────────────────────────────┤
│ │ 1111111111111111111111111 │ 1111111111111 11 │
│ │ 2677 1111112222222222333333333 │ 66 0001111111111 22 │
│ │ 3857 4567890123456789012345678 │ 45 7890123456789 48 │
│ │ ═══════════CDR3══════════ │ ═════CDR3════ │
│reference │ VASY ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦ │ KL CGTWD◦◦◦◦◦◦◦◦ KL │
│donor ref │ LASY ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦ │ KL CGTWD◦◦◦◦◦◦◦◦ KL │
├───────────┼─────────────────────────────────────────────┼────────────────────────────────┤
│# n │ .... ......................... u const │ .. ............. .. u const│
│1 1 │ LTNY CARAYDILTGYYERGYSYGWGFDYW 16 IGHM │ KF CGTWDSSLSAVVF TP 15 IGLC2│
└───────────┴─────────────────────────────────────────────┴────────────────────────────────┘
CHAIN 1 OF #1 • CONCATENATED VDDJ REFERENCE • D = 1ST = IGHD3-9:IGHD5-18
C A R A Y D I L T G Y Y E R G Y S Y G W G F D Y W
* |||* ||||| *||***
ACTGTGCGAGAG CTTACGATATTTTGACTGGTTATTACGAACGTGGATACAGCTATGGTTG GGGCTTTGACTACTGG
ACTGTGCGAAAGAGTATTACGATATTTTGACTGGTTATTA GTGGATACAGCTATGGTTACACTACTTTGACTACTGG