[1] GROUP = 1 CLONOTYPES = 1 CELLS
[1.1] CLONOTYPE = 1 CELLS
┌───────────┬─────────────────────────────────────────────────┬───────────────────────────┐
│ │ CHAIN 1 │ CHAIN 2 │
│ │ 190.1.1|IGHV4-39 ◆ 13|IGHD2-15 ◆ 57|IGHJ5 │ 219|IGKV1-12 ◆ 216|IGKJ4 │
│ ├─────────────────────────────────────────────────┼───────────────────────────┤
│ │ 111111111111111111111 │ 11111111111 │
│ │ 135 222222223333333333444 │ 369 01111111111 │
│ │ 648 234567890123456789012 │ 155 90123456789 │
│ │ ═════════CDR3════════ │ ════CDR3═══ │
│reference │ LPS ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦W │ SPT CQQ◦◦◦◦◦◦◦◦ │
│donor ref │ VPS ◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦◦W │ SPT CQQ◦◦◦◦◦◦◦◦ │
├───────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────────────────┤
│# n │ ... ..................... u const d1_name │ ... ........... u const│
│1 1 │ VPG CARYIVVVVAATINVGWFDPW 4 IGHG1 IGHD2-15 │ SPT CQQANSFPLTF 2 IGKC │
└───────────┴─────────────────────────────────────────────────┴───────────────────────────┘
CHAIN 1 OF #1 • CONCATENATED VDJ REFERENCE • D = 1ST = IGHD2-15
ATGGATCTCATGTGCAAGAAAATGAAGCACCTGTGGTTCTTCCTCCTGGTGGTGGCGGCTCCCAGATGGGTCCTGTCCCAGCTGCAGCTGCAGGAGTCGG
ATGGATCTCATGTGCAAGAAAATGAAGCACCTGTGGTTCTTCCTCCTGGTGGTGGCGGCTCCCAGATGGGTCCTGTCCCAGCTGCAGCTGCAGGAGTCGG
* *
GCCCTGGACTGGTGAAGCCTTCGGAGACCCTGTCCCTCACCTGCACTGTCTCTGGTGGCTCCATCAGCAGTAGTGGTTACTACTGGGGCTGGATCCGCCA
GCCCAGGACTGGTGAAGCCTTCGGAGACCCTGTCCCTCACCTGCACTGTCTCTGGTGGCTCCATCAGCAGTAGTAGTTACTACTGGGGCTGGATCCGCCA
GCCCCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATTGGGAGTATCTATTATAGTGGGAGCACCTACTACAACCCGTCCCTCAAGAGTCGAGTCACCATATCCGTAGAC
GCCCCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATTGGGAGTATCTATTATAGTGGGAGCACCTACTACAACCCGTCCCTCAAGAGTCGAGTCACCATATCCGTAGAC
* *||||
ACGTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGAGCTCTGTGACCGCCGCAGACACGGCTGTGTATTTCTGTGCGAGAT ATATTGTAGTGGTGGTAGCT
ACGTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGAGCTCTGTGACCGCCGCAGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGACAAGGATATTGTAGTGGTGGTAGCT
**|||||****
GCTACTATAAACGTAGGCTGGTTCGACCCCTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAG
GCTACTCC ACAACTGGTTCGACCCCTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAG